Proteínas Cas: Análisis estadístico en diferentes microorganismos
Por: Camilo Stevan Peralta Rache y Yessica Dayana Hoyos Gauta.
Actualmente, la herramienta de edición genómica más utilizada es el CRISPR Cas, la cual es parte del sistema inmune de diferentes microorganismos, en especial bacterias. En general, las proteínas Cas varían (Cas 2, Cas 3, Cas 9…) y cumplen la función de tijeras moleculares que asociadas a cadenas llamadas CRISPR (la cual es como un registro genético de invasores),comparan estas con cadenas de ADN sospechosas, y si coinciden la proteína Cas inhabilitará la cadena cortándole(más información aquí).
Si el Crispr Cas de la bacteria no llegara a identificar correctamente el ADN viral, estos virus bacteriófagos inyectarían su ADN a las bacteria, las cuales, por defecto y con ayuda de su maquinaria genética, producirán más virus al punto de poder hacerla estallar.
Además, la aplicación del CRISPR Cas 9 en investigación, ha revolucionado totalmente el alcance de la ingeniería genética. Generando posibilidades incluso a organismos genéticamente modificados, cosa que hace unos años solo se veía en películas y que ahora son posibles. Tal cual es el caso de la creación de “peces brillantes” en Taiwán, los cuales fueron creados al inyectar genes, que producían proteínas fluorescentes en la medusa abisal y coral, a óvulos fertilizados de peces medaka y cebra.
La tecnología ha avanzado lo suficiente como para tener al alcance las databases que contienen las cadenas de ADN, las cuales dan las instrucciones en diferentes organismos para construir las proteínas Cas. De las cuales varias fueron analizadas con el objetivo de:
- Comparar estadísticamente la frecuencia y porcentaje de aminoácidos entre las diferentes proteínas Cas.
- Comparar las mismas proteínas Cas en diferentes microorganismos.